libSBML Perl API  libSBML 5.10.0 Perl API
 All Classes Namespaces Files Functions Variables Typedefs Enumerations Enumerator Friends Macros Modules Pages
Class Index
A | B | C | D | E | F | G | I | K | L | M | O | P | Q | R | S | T | U | V | X
  A  
SBaseRef   
SBMLConstructorException   
AlgebraicRule   SBMLConverter   
AssignmentRule   SBMLConverterRegistry   
Association   SBMLDocument   
ASTNode   SBMLDocumentPlugin   
  B  
SBMLDocumentPluginNotRequired   
SBMLError   
BoundingBox   SBMLErrorLog   
  C  
SBMLExtension   
SBMLExtensionException   
CobraToFbcConverter   SBMLExtensionNamespaces   
Compartment   SBMLExtensionRegister   
CompartmentGlyph   SBMLExtensionRegistry   
CompartmentType   SBMLFileResolver   
CompBase   SBMLFunctionDefinitionConverter   
CompExtension   SBMLIdConverter   
CompFlatteningConverter   SBMLInferUnitsConverter   
CompModelPlugin   SBMLInitialAssignmentConverter   
CompPkgNamespaces   SBMLInternalValidator   
CompSBasePlugin   SBMLLevelVersionConverter   
CompSBMLDocumentPlugin   SBMLLocalParameterConverter   
CompValidator   SBMLNamespaces   
Constraint   SBMLReactionConverter   
ConversionOption   SBMLReader   
ConversionProperties   SBMLResolver   
CubicBezier   SBMLResolverRegistry   
Curve   SBMLRuleConverter   
CVTerm   SBMLStripPackageConverter   
  D  
SBMLUnitsConverter   
SBMLUri   
Date   SBMLValidator   
DefaultTerm   SBMLVisitor   
Delay   SBMLWriter   
Deletion   SBO   
Dimensions   SimpleSpeciesReference   
  E  
Species   
SpeciesGlyph   
Event   SpeciesReference   
EventAssignment   SpeciesReferenceGlyph   
ExternalModelDefinition   SpeciesType   
  F  
StoichiometryMath   
Submodel   
FbcExtension   SyntaxChecker   
FbcModelPlugin   
  T  
FbcPkgNamespaces   
FbcSBMLDocumentPlugin   TextGlyph   
FbcSpeciesPlugin   Token_t   
FbcToCobraConverter   Transition   
FbcValidator   Trigger   
FluxBound   
  U  
FluxObjective   
FormulaTokenizer_t   Unit   
FunctionDefinition   UnitDefinition   
FunctionTerm   
  V  
  G  
Validator   
GeneAssociation   VConstraint   
GeneralGlyph   
  X  
GraphicalObject   
  I  
XMLAttributes   
XMLConstructorException   
InitialAssignment   XMLError   
Input   XMLErrorLog   
  K  
XMLLogOverride   
XMLNamespaces   
KineticLaw   XMLNode   
  L  
XMLToken   
XMLTriple   
L3ParserSettings   
  d  
Layout   
LayoutExtension   doc_about_mathml_semantic_annotations   
LayoutModelPlugin   doc_additional_typecode_details   
LayoutPkgNamespaces   doc_algebraicrule_setting_lv   
LayoutSBMLDocumentPlugin   doc_astnode_types   
LayoutSpeciesReferencePlugin   doc_base_units   
LayoutValidator   doc_compartment_both_size_and_volume   
LineSegment   doc_compartment_units   
List   doc_compartmenttype_setting_lv   
ListOf   doc_config_for_reading_zipped_files   
ListOfCompartmentGlyphs   doc_config_for_writing_zipped_files   
ListOfCompartments   doc_constraint_setting_lv   
ListOfCompartmentTypes   doc_cvterm_common_description   
ListOfConstraints   doc_date_string_format   
ListOfDeletions   doc_delay_setting_lv   
ListOfEventAssignments   doc_delay_units   
ListOfEvents   doc_errorlog_what_are_severities   
ListOfExternalModelDefinitions   doc_event_setting_lv   
ListOfFluxBounds   doc_event_using_useValuesFromTriggerTime   
ListOfFluxObjectives   doc_eventassignment_units   
ListOfFunctionDefinitions   doc_id_syntax   
ListOfFunctionTerms   doc_initialassignment_units   
ListOfGeneAssociations   doc_kineticlaw_units   
ListOfGraphicalObjects   doc_localparameter_units   
ListOfInitialAssignments   doc_note_assignmentRule_setting_lv   
ListOfInputs   doc_note_charge_deprecated   
ListOfLayouts   doc_note_compartment_setting_lv   
ListOfLineSegments   doc_note_compartment_volume   
ListOfLocalParameters   doc_note_eventassignment_setting_lv   
ListOfModelDefinitions   doc_note_functiondefinition_setting_lv   
ListOfObjectives   doc_note_initialassignment_setting_lv   
ListOfOutputs   doc_note_kineticlaw_setting_lv   
ListOfParameters   doc_note_localparameter_setting_lv   
ListOfPorts   doc_note_mathml_semantic_annotations_uncommon   
ListOfQualitativeSpecies   doc_note_model_setting_lv   
ListOfReactionGlyphs   doc_note_modifierspeciesreference_setting_lv   
ListOfReactions   doc_note_object_is_copied   
ListOfReferenceGlyphs   doc_note_parameter_about_constant   
ListOfReplacedElements   doc_note_parameter_setting_lv   
ListOfRules   doc_note_priority_only_l3   
ListOfSpecies   doc_note_priority_setting_lv   
ListOfSpeciesGlyphs   doc_note_raterule_setting_lv   
ListOfSpeciesReferenceGlyphs   doc_note_reaction_setting_lv   
ListOfSpeciesReferences   doc_note_sbmlreader_error_handling   
ListOfSpeciesTypes   doc_note_spatial_dimensions_as_double   
ListOfSubmodels   doc_note_species_setting_lv   
ListOfTextGlyphs   doc_note_species_units   
ListOfTransitions   doc_note_speciesreference_setting_lv   
ListOfUnitDefinitions   doc_note_speciestype_setting_lv   
ListOfUnits   doc_note_stoichiometrymath_availability   
LocalParameter   doc_note_stoichiometrymath_setting_lv   
  M  
doc_note_timeunits_substanceunits   
doc_note_unassigned_unit_are_not_a_default   
Model   doc_note_unit_analysis_depends_on_model   
ModelCreator   doc_note_unit_inference_depends_on_model   
ModelDefinition   doc_note_unit_setting_lv   
ModelHistory   doc_note_unitdefinition_setting_lv   
ModifierSpeciesReference   doc_rule_level_1   
  O  
doc_rule_units   
doc_rules_general_summary   
Objective   doc_sbase_what_is_user_data   
Output   doc_sbml_error_code_ranges   
  P  
doc_sbml_error_table   
doc_sbmldocument_default_level   
Parameter   doc_sbmldocument_default_version   
Point   doc_sbmlnamespaces_what_is_it   
Port   doc_sbmlreader_if_compressed   
Priority   doc_summary_of_string_math   
  Q  
doc_summary_of_string_math_l3   
doc_warning_delay_math_literals   
QualExtension   doc_warning_event_timeUnits   
QualitativeSpecies   doc_warning_eventassignment_math_literals   
QualModelPlugin   doc_warning_initialassignment_math_literals   
QualPkgNamespaces   doc_warning_kineticlaw_math_literals   
QualSBMLDocumentPlugin   doc_warning_L1_math_string_syntax   
QualValidator   doc_warning_modifying_structure   
  R  
doc_warning_reaction_cant_ignore_fast   
doc_warning_rule_math_literals   
RateRule   doc_warning_species_spatialSizeUnits   
RDFAnnotationParser   doc_warning_typecodes_not_unique   
Reaction   doc_warning_unit_offset_only_l2v1   
ReactionGlyph   doc_warning_useValuesFromTriggerTime   
ReferenceGlyph   doc_what_are_annotations   
ReplacedBy   doc_what_are_cvterms   
ReplacedElement   doc_what_are_notes   
Replacing   doc_what_are_plugins   
Rule   doc_what_are_sbmlnamespaces   
  S  
doc_what_are_typecodes   
doc_what_is_astnode   
SBase   doc_what_is_listof   
SBaseExtensionPoint   doc_what_is_metaid   
SBasePlugin   doc_what_is_metaidref   
SBasePluginCreator   doc_what_is_SBMLDocument   
SBasePluginCreatorBase   doc_what_is_sid   
A | B | C | D | E | F | G | I | K | L | M | O | P | Q | R | S | T | U | V | X